颜色不同：金针菇和银针菇的颜色不一样，金针菇为米白色至黄褐色，银针菇则主要是白色。

生长环境不同：金针菇通常在自然环境下生长，它会随着光照、气温、湿度的变化而出现变化，属于绿色食品。银针菇是金针菇的变种，多是人工培育所种植的，属于统一工厂化生产，它生长并不会随着生长环境的变化而变化，因此它是白色的。

生长周期不同：金针菇和银针菇的生长周期有很大区别，金针菇生长周期长，大概是90天，银针菇的生长周期为30天左右。

主要区别在颜色上，金针菇的颜色是黄颜色的，银针菇的颜色是白颜色的，其它方面几乎没有什么区别，食用方法都基本相同。