海蛎子外壳和内脏不能吃，藏有很多脏的东西，如果真的要吃的话，应该洗干净煮熟了再吃，海蛎子的内脏团中容易藏着重金属等污染物，稍微发黑或者有异气味不能吃。

海蛎子的食用方法较多，鲜牡蛎肉通常有清蒸、鲜炸、生灼、炒蛋、煎蚝饼、串鲜蚝肉和煮汤等多种，配以适当调料清蒸，可保持原汁原味；若食软炸鲜蚝，可将蚝肉加入少许黄酒略腌，然后将蚝肉蘸上面糊，用油锅煎至金黄色，以酱油、醋佐食；吃火锅时，可用竹签将牡蛎肉串起来，放入沸汤滚一分钟左右取出便可食用；若配以肉块姜丝煮汤，煮出的汤白似牛奶，鲜美可口。

牡蛎肉亦可加工成干品，商品称为蚝豉，若把鲜牡蛎肉及汁液一起煮熟晒干或烘干后便成为熟蚝豉，若要保持全味则不煮，将牡蛎肉直接晒干，便成为有名的生晒蚝豉，蚝豉食用也各式各样。

生蚝内侧与贝壳连接处黑色部分是不可以食用的，这部分是生蚝的内脏，里面含有很多细菌和未消化的杂质，所以不可以食用，其他部分都可以食用。

　　牡蛎别名又叫生蚝，是所有食物中含锌最丰富的(每100g牡蛎,不包括壳的重量，含水87.1%，含锌71.2mg，富含蛋白锌，是很好的补锌食物，要补锌可以常吃牡蛎或蛋白锌。为牡蛎科（ostreae）动物牡蛎（ostreagigastnunb）及其近缘动物的全体，是海产贝壳。在亚热带、热带沿海都适宜蚝的养殖，我国分布很广，北起鸭绿江，南至海南岛，沿海皆可产蚝。蚝乃软体有壳，依附寄生的动物，咸淡水交界所产尤为肥美。